GigaScience

Information om GigaScience

Författare: Oskar Westergren, Christer Lagvik, Björn Ericsson, Elisabeth Näverå, Magnus Åberg

Senast uppdaterad: 2019-04-08

URL: https://academic.oup.com/gigascience

Ämnesområden/typ av data: Hela spektrumet av livsvetenskaper och biomedicin inom kategorin ”big data”, information som är så omfattande att den är svår att behandla genom traditionell databashantering. GigaScience (GS) publicerar även mjukvaruverktyg, forskningsdata och arbetsflödet från de studier som publiceras.

Redaktionell policy

Studien ska inte vara publicerad i samma form som den inlämnas till GS och forskare ska lämna referenser till egna likartade tidigare publikationer. Allt material som publiceras genomgår peer review. Forskare uppmanas att presentera och tillgängliggöra sina data före publicering, i kontrast mot ”Ingelfinger Rule”. Tillgängliggörande av forskningsdata är ett krav för publicering, GS hänvisar till Force 11 Data Citation Principles. GS förväntar sig att vedertagna ämnesstandarder följs, standarderna listas. De personer som anges som författare måste också kvalificera som författare enligt riktlinjer från GS, eller annars anges som medarbetare/bidragande. Självplagiat, möjliga intressekonflikter eller bias ska anges vid inlämnande av manus. GS ställer krav på efterlevnad av etiska lagar och standarder gällande försök på människor, djur och växter.

Peer review

Artikeln bedöms först av en redaktör. Om artikeln passerar första bedömningen genomgår den öppen peer review av minst två sakkunniga. Namnen på de sakkunniga som utfört peer review publiceras både i studiens peer review rapport och ”förpubliceringshistorik”. Peer review processen är detaljerad och styrd, med tydliga instruktioner för sakkunniga. All data, mjukvara och kod som studien bygger på ska, så långt det är möjligt, finnas tillgänglig för de sakkunniga.

Open access

Tidskriften är Open Acess ”Gold” dvs återanvändning är inte kontraktstyrd och studierna är fritt tillgängliga. Det kostar mellan 9000-17000kr att publicera en artikel i GS. GS använder Creative Commons Attribution Licens 4.0.

Publicering av dataset

Dataset ska göras öppet tillgängliga i publika repositorier eller hos GigaDB, tidskriftens egen databas för dataset. Tidskriften tar emot material upp till 1TB för lagring på tidskriftens server. Det går att kontakta en redaktör för att få mer utrymme. Dataset ska vara tillgängliga under en CC0-licens, när så är möjligt.

Artiklarnas struktur

Artiklarnas struktur är något styrt, det finns instruktioner för utformningen av rubriker/avsnitt i publikationer, kategorierna för rubriker tycks vara fasta. Även viss styrning av layout, referenser, numrering av bilder, godkända filformat för text och bilder mm. Särskild vikt lägg på dokumentation av data, tillhörande kod och metodik för att säkerställa reproducerbarhet och återanvändning av materialet.

Beskrivning av dataseten

Fullständig information om dataset ska anges enligt GS hänvisningar till aktuella ämnesstandarder. Eventuell källkod ska vara Open Source samt beskrivas grundligt. Nödvändig programvara för att nyttja källkoden ska inkluderas i publikationen.

Övrigt

Tidskriften inrättades 2012. Nuvarande förlag: Oxford University Press och the Beijing Genomics Institute. Ansvarig utgivare är Laurie Goodman. Impact factor för 2017 (JCR): 7.267. Vid dags datum finns ca 500 publicerade artiklar. GigaScience har ytterligare resurser som stödjer fokuseringen på öppenhet, reproducerbarhet och återanvändande av datadriven forskning:

GigaDB: integrerad databas för forskning som stödjer sig på GigaScience artiklar
GigaYou Tube: videor tillhörande artiklar och författar- och redaktörspresentationer
GigaBlog: datadriven blogging från GigaScience redaktörer och gäster
GigaGalaxy: Galaxy workflow värdserver för dataanalyser från GigaScience artiklar
GigaGithub: GitHub repositorium för kod associated med GigaScience artiklar
Protocols.io: nedladdningsbara, citerbara och uppspaltningsbara (forkable) metoder från GigaScience artiklar
Koppling till Publons: sök transparenta, underskrivna och citerbara peer-reviews från GigaScience artiklar